mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAAGACTAGTGATTTTGTTGT AGTAAATCACAGTCTTCCTTA GTGTTCTGTATGGAAGACTAGTGATTTTGTTGTTGTGTGTCTTGCAAACAACAGTAAATCACAGTCTTCCTTACGGTGCATC 3 2 5' arm Branchiostoma_floridae mirbase mir-7 4e-40 tgu-mir-7-4 0.0000000003 -37.2 ((((.(((((.((((((((.(((((((...((((((.((.....)).))))))..))))))))))))))).))))).)))). (-37.20)