mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGCATTGTAGTTGCATTGCAT GCAATGTAACAGCAGTGCAGCT GCTGAGGTGCATTGTAGTTGCATTGCATGTGCACAAAGGAAGTGCAATGTAACAGCAGTGCAGCTCAGACATGGTTGCAATG 2 0 5' arm Branchiostoma_floridae mirbase mir-33 4e-31 bfl-mir-33-2 3e-16 -39 .(((((.((((((((.((((((((((((.(.(.....).).)))))))))))).)))))))).))))).............. (-39.00)