mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGGCAGTGATGTCAGTTTGTTGT AACAACTAACATCACTGCCAAG TATTGTGCGCTACAGAGGCAGTGATGTCAGTTTGTTGTGTGACACGAGACGACAACAACTAACATCACTGCCAAGGAAACGC 2 1 5' arm Branchiostoma_floridae mirbase 100 bfl-mir-34b 2e-41 -31.5 ..(((((...))))).(((((((((((.((((.(((((((........)).))))))))).)))))))))))..(....).. (-31.50)