mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTAGAGATTGTGTGACGGGTAGT TGCCTGTCAACGTCTCTGTACA ACTCTCTGCCTGTCAACGTCTCTGTACAGTGAACATGAGGCATGTGTAGAGATTGTGTGACGGGTAGTGAGCCC 1 2 3' arm Branchiostoma_floridae mirbase 100 100 -31.8 .(((.(((((((((((((((((((((((((.........)).)))))))))).))).)))))))))).)))... (-31.80)