mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCGTAACAGGACGCTCGTCTGC AGATGAGCTGTTCTGCTACAGCTG TGGCTGTTTGGGAAGATGAGCTGTTCTGCTACAGCTGCTTGTCGGACTAGCGTAACAGGACGCTCGTCTGCCCAAACATCTGGCCACT 2 2 3' arm Branchiostoma_floridae mirbase 100 bfl-mir-4891 7e-45 -43.2 ((((((((((((.((((((((.((((((.(((.((((.((....)).))))))).)))))))))))))).)))))))....))))).. (-43.20)