mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAGGTAGTGGGTTGCATAGT TATACAACCTGCTGCCTTTCT ATTGGGCTCCTAGGAAGAGGTAGTGGGTTGCATAGTTTTAGGGCAGGGATTTTGCTCACAAGGAGGTAACTATACAACCTGCTGCCTTTCTTAGGGCTTTATT 4 0 5' arm Gallus_gallus mirbase let-7 9e-42 mdo-let-7d 5e-43 -44 ...((((.(((((((.(((((((..(((((.((((((...((((((.....)))))).(.....)..)))))).)))))..)))))))))))))))))).... (-44.00)