mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAATGTAAAGAAGTATGTA CATACTTCTTTATATGCCCATA TGAGAGACATACTTCTTTATATGCCCATATGAACCTGGCAATCTATGGAATGTAAAGAAGTATGTATTTCA 2 1 3' arm Gallus_gallus mirbase mir-1 1e-33 tgu-mir-1-1 2e-29 -28.3 .((((.((((((((((((((((..(((((.((.........))))))).)))))))))))))))).)))). (-28.30)