mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAATGTTAAGAAGTATGTA CATACTTCTTCATATGCCCATA ACATACTTCTTCATATGCCCATATGGAGTCGGCCGGCGTTATGGAATGTTAAGAAGTATGTATC 3 1 3' arm Gallus_gallus mirbase mir-1 2e-29 xla-mir-1b 0.000003 -24.2 (((((((((((.((((..(((((....(((....)))..))))).)))).)))))))))))... (-24.20)