mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAAGACTAGTGATTTTTGTT CAAATCACAGTCTACCATA TGGACATTGGTCTAGTTCTGTGTGGAAGACTAGTGATTTTTGTTGTTTTTAGATAACTAAATTGACAACAAATCACAGTCTACCATATGGCACAGACTATGCCTCTACAG 1 3 5' arm Gallus_gallus mirbase mir-7 1e-44 gga-mir-7-1 5e-40 -42.3 .((.(((.(((((.((.((((((((.(((((.((((((..((((((((((((....)))))..)))))))))))))))))).)))))))).))))))))))))....... (-42.30)