mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTTGGTTATCTAGCTGTATGA ATAAAGCTAGAGAACCGAATGTA TTGGGTTGGTTTTTCTCTTTGGTTATCTAGCTGTATGAGTGTATGTGATATCATAAAGCTAGAGAACCGAATGTAAAAACCCGCTCGC 3 0 5' arm Gallus_gallus mirbase mir-9 6e-24 dre-mir-9-4 2e-32 -34 ..((((.(((((((.(.(((((((.(((((((.(((((.(((.....)))))))).))))))).))))))).).))))))).)))).. (-34.00)