mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTTGGTTATCTAGCTGTATGA ATAAAGCTAGATAACCGAAAGTA GGAAGCGAGTTGTTATCTTTGGTTATCTAGCTGTATGAGTGTTTTGGTCTTCATAAAGCTAGATAACCGAAAGTAAAAACTCCTTCA 3 0 5' arm Gallus_gallus mirbase mir-9 9e-20 age-mir-9 6e-42 -40.1 .((((.(((((.(((..(((((((((((((((.((((((..(....)..)))))).)))))))))))))))..))).))))))))). (-40.10)