mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGGTGCATCTAGTGCAGATA CTGCCCTAAGTGCTCCTTCTGGC GTGCTTTTTGTACTAAGGTGCATCTAGTGCAGATAGTGAAGTAGATTAGCATCTACTGCCCTAAGTGCTCCTTCTGGCATAAGAAGTTATGTC 4 3 5' arm Gallus_gallus mirbase 100 cfa-mir-18a 7e-45 -27.3 ..(((((((((.((((((.(((..(((.((((.(((((..(.....)..)).))))))).)))..))).)))..))).)))))))))...... (-27.30)