mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCTTATCAGACTGATGTTGA AACAACAGTCGGTAGGCTGTC TGTACCATCCTGTCGGATAGCTTATCAGACTGATGTTGACTGTTGGATCTCATGGCAACAACAGTCGGTAGGCTGTCTGACATTTTGGTATCTCTCA 2 1 5' arm Gallus_gallus mirbase mir-21 5e-34 tgu-mir-21 3e-35 -45.7 .((((((...((((((((((((((((.(((((.(((((.((((........))))))))).)))))))))))))))))))))...))))))...... (-45.70)