mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCACCATTTGAAATCAGTGTT GCTGGTTTCACATGGTGGCTTAGA CCTCTGGAAGCTGGTTTCACATGGTGGCTTAGATTTTCCCACTTTGTATCTAGCACCATTTGAAATCAGTGTTCTAGGAG 1 3 3' arm Gallus_gallus mirbase mir-29 1e-33 tgu-mir-29b-2 3e-34 -31.02 ..(((((((((((((((((.((((((.((.((((.............)))))))))))).)))))))))).))))))).. (-31.02)