mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGCAGTGTCTTAGCTGGTTGTT CAATCAGCAAGTATACTGCCCTA GCCAGCTGTGAGTGTTTCTTTGGCAGTGTCTTAGCTGGTTGTTGTGAGCAATAGTTAAGGAAGCAATCAGCAAGTATACTGCCCTAGAAGTGCTACACATTGTTGGGCC 1 2 5' arm Gallus_gallus mirbase mir-34 2e-45 mml-mir-34a 4e-50 -50.6 .(((((((((((..(((((..(((((((((((.((((((((((...(((....))).....))))))))))))).))))))))..)))))..)).))))..)))))... (-50.60)