mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTACAGTACTGTGATAACTGAA CGGTTATCATGGTACCGGTGCTG ACTATCCTTTTTCGGTTATCATGGTACCGGTGCTGTATACGTGAAAGGTACAGTACTGTGATAACTGAAGAATGGTGGT 1 1 3' arm Gallus_gallus mirbase mir-101 6e-36 tgu-mir-101-1 2e-35 -35.4 ((((((.((((((((((((((((((((..(((((............))))).)))))))))))))))))))).)))))) (-35.40)