mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTAAGGCACGCGGTGAATGCCA GTGTTCACAGCGGACCTTGATT AGGCTCTGCCTCTCCGTGTTCACAGCGGACCTTGATTTAATGTCATACAATTAAGGCACGCGGTGAATGCCAAGAGCGGATCCTCCAGGCGGCATT 5 0 3' arm Gallus_gallus mirbase mir-124 3e-35 tgu-mir-124-1 7e-39 -35.7 (((.(((((.(((..((((((((.(((..((((((((...........))))))))..))).))))))))..)))))))).)))............ (-35.70)