mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGTACCGTGAGTAATAATGCGC CCATTATTACTTTTGGTACGCGC GCTGGTGACGGCCCATTATTACTTTTGGTACGCGCTGTGACACTTCAAACTCGTACCGTGAGTAATAATGCGCTGTGGTCAGCA 3 0 3' arm Gallus_gallus mirbase mir-126 4e-28 tgu-mir-126 6e-39 -41.3 (((((..(((((.(((((((((((.(((((((.(...(((....)))..).))))))).))))))))))).)))))..))))). (-41.30)