mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGGCTGAGGCTGTGCTGGTTGT AAGCTGCGCAGACCCACAGGCACT TGACCTGGGCAGCCAGTGAGGCTGAGGCTGTGCTGGTTGTCTTTGTGTCAGGTACAAGCTGCGCAGACCCACAGGCACTGGCTGCCTTAAATCA 6 2 5' arm Gallus_gallus mirbase 100 gga-mir-1609-2 2e-48 -45.6 .((...((((((((((((...(((.((((((((.(.(((((((......))).)))).).)))))).))..))).))))))))))))....)). (-45.60)