mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGGTTTTATGGTTTTGTTTT AACAAAACCCAAAAACCCAGA TTGCTAACCTCCTTTTTAGGTTTTATGGTTTTGTTTTTAAAACAAAACCCAAAAACCCAGAGAGCAGTTGTTTCCAA 5 0 5' arm Gallus_gallus mirbase 100 100 -21.3 .((..(((((.((((((.((((((..(((((((((.....)))))))))..)))))).)))))).))..)))..)). (-21.30)