mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGTCCCCTTCAACCAGCTG GCTGGTAAAATGGAACCAAAT AATGCTTTGCTAAAGCTGGTAAAATGGAACCAAATCAACTGTTCAATGGATTTGGTCCCCTTCAACCAGCTGTAGCTGTGCATTGA 5 0 3' arm Canis_familiaris mirbase mir-133 3e-35 gga-mir-133a-2 1e-43 -34.7 (((((...((((.(((((((..((.((.((((((((............)))))))).)).))..))))))).))))...))))).. (-34.70)