mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GATCTCGGACCAGGCTTCATT TGAAGTTTGTTCCAAGATCCT TGAGGTTGTTTGGAATGAAGTTTGTTCCAAGATCCTTTTTTTGGTTTTTGAGGGATCTCGGACCAGGCTTCATTCTTGACAGTCGT TGTGGGTTTTTCGATTCTTGAGTTATTCATGAGAGAGAAATAGAGAAAGAAAGAAATGAGGTTGTTTGGAATGAAGTTTGTTCCAAGATCCTTTTTTTGGTTTTTGAGGGATCTCGGACCAGGCTTCATTCTTGACAGTCGTCTTTTCGGTATGTGTTTAAAGTTTAATCGATGGATTGGAAACGGTTGCATGATTTTTTTTGTAAGCTTCATGGATTTTTGATTTAGTTATTGGTTTTGTTCTTTTTATTAGTTTCCTTTTGTGTTTCACAATATCTTTTTTTTTCCTTAGAAGCTGAATTTGCTTCCTATTCTTTTGCATTTTATGTAAAGGAAATCAAGGGGCTCTTTGATTACCTCTTAATGGAACCGTTCAAATATTAGCTATGAATCAGCCAACATTCCGAACGTTCTCTTAATGAATCAAAAATCCCTGAAATGTTAAGAAAACCTACTTTTTTTAACGAATATGGAACTTCAGAAATGAGTCTACGGGATGCTTTGGAGAATTTGGAACTTCAGAAATGAGAAGGTGTTTAATGCTCGTTGTGTCTCTGTTTCGGGGGTTTATGATGATATTATTTCCACGGTTTTCTTTTGGGCGAAGCATAGAGCTAAATTGGGGAGATGTAACCGAGATAGTTGGAACTTTTCTCCGTTTACTTGTTTGTAATAGTTTGTTTTGTTGCTGTACTCTCGTTCCCC 2 0 3' arm Taraxacum_kok-saghyz mirnest mir-166 0.000005 ptc-MIR166o 0.0000003 -36.7 ...(((((((.(((((((((((((.(((.(((((((((...........))))))))).))).))))))))))))).))))))).. (-36.7)