mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAAGACTAGTGATTTTGTT CGAATCCCAGTCTGCCGAA CTGGATACAGAGTGAAGTGGCTGGCCCCGTCTGGAAGACTAGTGATTTTGTTGTTGTCTTACTGCGCTCAACAACGAATCCCAGTCTGCCGAATGGTGCCAGCCATTGCA 2 2 5' arm Macaca_nemestrina mirbase mir-7 2e-43 mml-mir-7-2 2e-55 -47.7 (((....)))..((.((((((((((.((((.(((.(((((.(.(((((.(((((((............))))))))))))).))))).))).)))).)))))))))).)) (-47.70)