mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCAGCACATAATGGTTTGTG CAGGCCATATTGTGCTGCCTCA CCTTGGAGTAAAGTAGCAGCACATAATGGTTTGTGGATTTTGAAAAGGTGCAGGCCATATTGTGCTGCCTCAAAAATACAAGG 4 0 5' arm Macaca_nemestrina mirbase mir-15 4e-31 age-mir-15a 6e-42 -30.74 (((((.......(..((((((((..((((((((((..((.....))..))))))))))..))))))))..).......))))) (-30.74)