mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CATTGCACTTGTCTCGGTCTGA AGGCGGAGACTTGGGCAATTGCT GGCCAGTGTTGAGAGGCGGAGACTTGGGCAATTGCTGGACGCTGCCCTGGGCATTGCACTTGTCTCGGTCTGACAGTGCCGGCC 6 1 3' arm Macaca_nemestrina mirbase mir-25 7e-39 eca-mir-25 2e-42 -37.8 ((((.(..(((..((((.(((((..(.(((((.(((((.......))..)))))))).)..))))).))))..)))..).)))) (-37.80)