mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGCATTGTAGTTGCATTG ATGTTTCCACAGTGCATTA CTGCGGTGCATTGTAGTTGCATTGCATGTTCTGGTGGTACCCATGCAATGTTTCCACAGTGCATTACAG 3 0 5' arm Macaca_nemestrina mirbase mir-33 3e-22 mml-mir-33a 1e-33 -32.4 (((..(((((((((.(..((((((((((....((.....))))))))))))..).)))))))))..))) (-32.40)