mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCAAATGCTCAGACTCCTGT GGATGTTTGAGCATGTGCTA TGTGCATCGTGGTCAAATGCTCAGACTCCTGTGGTGGCTGCTCATGCACCACGGATGTTTGAGCATGTGCTACGGTGTCTA 4 0 5' arm Macaca_nemestrina mirbase mir-105 2e-32 lla-mir-105 9e-41 -43.1 ...(((((((((.((.((((((((((..((((((((.(.......)))))))))..)))))))))).)))))))))))... (-43.10)