mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGTCCCCTTCAACCAGCTGT AGCTGGTAAAATGGAACCAAAT ACAATGCTTTGCTAGAGCTGGTAAAATGGAACCAAATCGCCTCTTCAATGGATTTGGTCCCCTTCAACCAGCTGTAGCTATGCATTGA 5 0 3' arm Macaca_nemestrina mirbase mir-133 1e-25 age-mir-133a 7e-45 -40.5 .((((((...((((.(((((((..((.((.((((((((............)))))))).)).))..))))))).))))...)))))). (-40.50)