mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTCCAGTTTTCCCAGGAATCCCTT GGGATTCCTGGAAATACTGTTCTT CACCTTGTCCTCACGGTCCAGTTTTCCCAGGAATCCCTTAAATGCTAAGATGGGGATTCCTGGAAATACTGTTCTTGAGGTCATGGTT 5 0 5' arm Macaca_nemestrina mirbase mir-145 3e-38 mml-mir-145 7e-45 -41.62 .(((.((.(((((.((..((((.((.((((((((((((.............)))))))))))).)).))))..))))))).)).))). (-41.62)