mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGTGTCTTGTGTTGCAGCCG GCTACAACACAGGACCCGGG GGTCAGGCTCACTATGACACAGTGTGAGACCTCGGGCTACAACACAGGACCCGGGTGCTGCTCTGACCCCTCGTGTCTTGTGTTGCAGCCGGAGGGACGCAGGTCCGCA 4 1 3' arm Macaca_nemestrina mirbase mir-187 9e-39 mml-mir-187 3e-57 -46.6 ((.(..((.((((.......)))).....((((.((((.((((((((((((.(((..(......)..)))..).))))))))))).)))).))))...))..).))... (-46.60)