mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCTTCATTCCACCGGAGTCTG GATTTCAGTGGAGTGAAGTTCA AAAGATCCTCAGGCAATCCATGTGCTTCTCTTGTCCTTCATTCCACCGGAGTCTGTCTCATACCCAACCAGATTTCAGTGGAGTGAAGTTCAGGAGGCATGGAGCTGACG 3 0 5' arm Macaca_nemestrina mirbase mir-205 9e-39 mml-mir-205 6e-58 -47.92 ........((((....(((((((....((((((..(((((((((((.((((((((.............)))))))).)))))))))))..))))))))))))).)))).. (-47.92)