mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGTGCTTGATCTAACCATGT ATGGTTCTGTCAAGCACCGCG GACCAGTCGCTGCGGGGCTTTCCTTTGTGCTTGATCTAACCATGTGGTGGAACGATGGAAACGGAACATGGTTCTGTCAAGCACCGCGGAAAGCACCGTGCTCTCCTGCA 4 0 5' arm Macaca_nemestrina mirbase mir-218 2e-43 lla-mir-218-2 6e-58 -46.3 ...(((..((.((((.(((((((...(((((((((..((((((((..........((....))..))))))))..)))))))))...))))))).))))))....))).. (-46.30)