mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAAGTCACTAGTGGTTCCGTTTA AATGGTGCCCTAGTGACTACAA GGGCTTTCAAGTCACTAGTGGTTCCGTTTAGTAGATGATTGTGCATTGTTTCAAAATGGTGCCCTAGTGACTACAAAGCCC 4 1 5' arm Macaca_nemestrina mirbase mir-224 2e-32 mml-mir-224 9e-41 -36.6 (((((((..(((((((((.(((.((((((.(.(((..((.....))..)))).)))))).))))))))))))..))))))) (-36.60)