mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACATCATCATCATCATCATCA GTGGTGGTGGTGGTGGGGCAT TGCATCGCACTACATCATCATCATCATCATCATCATCATTTCGGCATTCTTGGGACGACACACACATACACACACACACACGCGCGCGCGCGTGCCTATCCACGACATTTACATAGATATATAGCTCTCCTACATGCATGCGTAGTGCATGCATGTACGGGGATGGGGGGGGAAACCGGAGGGGAAGAAATGTGCGGCCGAACCAAAGGTGATGACGAGATGCGCGCGGCGGTGTGGCTGCATCTATCTACGTGAAACGGTGTTTCACGTGGTGGTGATGGTGATGAGTGTGATGGTGACGATGATGGTCGTAATGACAGCGATGATGATGATGCCGATGCTGATGCTGATTTTAAGGATGTCGCGGATAGGCGTGCGCGGGCGCTGCTGCTGCTACTGCTGCTGCTGCTGCTGCTCTGTGTGTTCCAGACTGGTGGGGAGGCCTTCCGGACGTTTTAGAGCCTTTTACGCCTCCTATCAGCTGCCCGCTACCCCTCCTGGCCCCTCCCTTCTCTCATCTACCTCGCGGTCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATGGTCATCGCACCATCGGGCTCATAGCGATTTCCAGCAGGACTAACTGCTGCTCGCGAGATCTCCACAACCGGTGACATTTTGCATACGCATTTTTGTTGTTTTGGGGTTTACTCCGGGGGATTCGTTCCCCGGGTAGTTTGAGGTGCCTGCCGTTTTTGGTGTGGTGGTGGTGGTGGTGGGGCATTGCGACTG TCGCGCAGTGGATGGATCCGTGCCTCCTGAGATGCATCGCACTACATCATCATCATCATCATCATCATCATTTCGGCATTCTTGGGACGACACACACATACACACACACACACGCGCGCGCGCGTGCCTATCCACGACATTTACATAGATATATAGCTCTCCTACATGCATGCGTAGTGCATGCATGTACGGGGATGGGGGGGGAAACCGGAGGGGAAGAAATGTGCGGCCGAACCAAAGGTGATGACGAGATGCGCGCGGCGGTGTGGCTGCATCTATCTACGTGAAACGGTGTTTCACGTGGTGGTGATGGTGATGAGTGTGATGGTGACGATGATGGTCGTAATGACAGCGATGATGATGATGCCGATGCTGATGCTGATTTTAAGGATGTCGCGGATAGGCGTGCGCGGGCGCTGCTGCTGCTACTGCTGCTGCTGCTGCTGCTCTGTGTGTTCCAGACTGGTGGGGAGGCCTTCCGGACGTTTTAGAGCCTTTTACGCCTCCTATCAGCTGCCCGCTACCCCTCCTGGCCCCTCCCTTCTCTCATCTACCTCGCGGTCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATCATGGTCATCGCACCATCGGGCTCATAGCGATTTCCAGCAGGACTAACTGCTGCTCGCGAGATCTCCACAACCGGTGACATTTTGCATACGCATTTTTGTTGTTTTGGGGTTTACTCCGGGGGATTCGTTCCCCGGGTAGTTTGAGGTGCCTGCCGTTTTTGGTGTGGTGGTGGTGGTGGTGGGGCATTGCGACTGGTATTGTATGTACACGCCTGCAATTAACTAACTAACAAACGAACCGGGGATTTGCATTTTGCTGAACAAACCTGTTTTCCCCGCGTCCATGTGTCCGTTTGACCAAACCTGTCGCGTGTTCAAAACGACATTACCCCTGGAATGAATGCGTTATATGTCCTACAGACCTATAGCTTTCCTTTTCAGAATTTGGACAGAACATAATACTCGGCTCGAAAGGATGGCGGTT 3 0 5' arm Volvox_carteri mirnest 100 100 -274.4 ....(((((.....((((((((((((((((((.(((((...(((((.(((((((..(((...((...(((........((((((....))))))(((.((((.......................((((((((((((((((.....))))))))))).)))))))))..)))..(((((.(((((.((...((((((....((((..((((((((..(((((...(((((......)))))...)))))(((((((((...)))))))))(((((((((((((((((..((((((((((.((((((((((.....)))...((((((((((((((((.....((((..((.....(((..((((.(((..((.(((.(((((((((((.((.((.......)).)).)).((((.((((.......)))).)))).(((((((.....((...........))......)))))))...))).))))))))).))))))))).)))....))...)))).......))).)))))))))))))..))))))).))))))))))..))))))))))))))))).)))))))).))))..))))))..))...(((...((((....((((((......)))))).))))))).)))))....))))).(((...(((....)))....))))))..))..)))(((.((((((((....))))))))))).)))))))....)))))....))))))))))))))))))))))).....)))))... (-274.4)