mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGCAAGTTGTCTTTGGCTACA CAGCCAAGGATGACTTGCCGA ATTTCCATGTAGAAAGTAGTGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGACTGTTTTGCCGAGCGCGGAAATAAAATGCAGCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTGTATATTTGCCGCCGTACGTATTTATACGAACTCCTCGGCAAGTTGTCTTTGGCTACATCCTACTTCCTTCATCTCTT TAGTGGATCCAAAGAATTCGGCACGAGGCTACAGTGAATTATTCCTTCATTTCCTTCTTCCTCTTAATTCTACGTTGCCATGGCAGAAGCAGCAGCATTTAATTAATTAATGCATTTCCATGTAGAAAGTAGTGTGCAGCCAAGGATGACTTGCCGACTGTTTTGCCGAGCGCGGAAATAAAATGCAGCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTGTATATTTGCCGCCGTACGTATTTATACGAACTCCTCGGCAAGTTGTCTTTGGCTACATCCTACTTCCTTCATCTCTTTTAATTAGGCTTTCGGCATCCAGTAAAGACGGAACTAAAGGGCCGAGCTGCGCTGGGATGGCGGCCAGCCATTACTCTCCATATTTGTAAACATTCTTTATGAATACTATTTATTATTTTATGTTTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1 0 3' arm Catharanthus_roseus mirnest MIR169_2 0.0000000007 ath-MIR169a 0.000000000009 -54.9 ......(((.((.((((((.(((.((((((((((((((((((((..((((....))))((((....((.((((((..................)))))).))..)))).((.((((....)))).))...)))))))))))))))))))).))).)))))).)).)))..... (-54.9)