mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATCATGCGATCTCTTTGGAAG TCCAAAGGGATCGCATTGATCC AGCAGGTGGAAGCTTCCAAAGGGATCGCATTGATCCGGTTTATCAATCGATTCGAGTTTGATTCATTCATCTATCATATCCATGGAAGCAGCTGCAAATTTTTTTATCCAATTTGATAATTTGGATCATGCGATCTCTTTGGAAGTTTCCGTCCGT AGGCAAAACGCTAGATTTGATTATGTTGCAGCAGGTGGAAGCTTCCAAAGGGATCGCATTGATCCGGTTTATCAATCGATTCGAGTTTGATTCATTCATCTATCATATCCATGGAAGCAGCTGCAAATTTTTTTATCCAATTTGATAATTTGGATCATGCGATCTCTTTGGAAGTTTCCGTCCGTGGCCCTCCATGTTTGCATTCATCCGTCTATCGCTTCCATTTGATTCCAAGATCACGGAACTTCATTGTGTTTTGTGTTTGGTTGTTTTATGCAACGTTTCTGCTCTTTGCTACCGGAATATATCCAGGGGGAACAACTTTTGAAGCTACAGATATAACTCCTCATGATGATTAATAGAATTGAATTACTTGATTACATCATCCCCAAATCTGCCAAATTGATTTTCGGTCTCTGAATTGGGTGAATTGTGTTTTCGATCATTTAAGACTGTTTGGGGTCTTAAAGCAATGTTTTTTTTTTCTTTAGATAGTTGATTAGGAAACTTATTCAAACCATTTTCGCGTATTAGGAATTAGGAGAGAAGCTTATTTTCTTCTCCTGTATGTATATATATTTTTTTTATGTTTTTAGGGGAGAAGAATTTTATTCAAGAATATCTTGAGTGGAGTTAAAAAA 0 1 3' arm Cichorium_endivia mirnest 100 sbi-MIR393 0.0000001 -59.3 ....((((((((((((((((((((((((((.(((((((.(((((((..(((..(((((((.........(((((.......)))))........)))))))....)))....))))))).))))))))))))))))))))))))))))))).)).. (-59.3)