mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCATAGCATCATGAGCAATCA ACTGCTAATGATGTTATCTCAT TATGTAAACCACCAAGAACATGCATAGCATCATGAGCAATCAGCCTTGGAAATATTTTTGAGCAAGTGACTGCTAATGATGTTATCTCATTTCTTGATGGCTCTTCTT AAATAACTATTTGGATTAACCATACTAAATGCCAAATACTTGGAAATTCTACATGGATACATACTACACAAAAGAAGTGGAAATGAAAGGATAACAAGTGCATAAAAATTACTAATAGTTGGAGGGACTTTGGCTCCAAAGCCCCAACCATAAGTTTTTATGTCAAAGATCATATGTAAACCACCAAGAACATGCATAGCATCATGAGCAATCAGCCTTGGAAATATTTTTGAGCAAGTGACTGCTAATGATGTTATCTCATTTCTTGATGGCTCTTCTTCCTCTTGGGGGGAAATCATAACCCTGGCCCCATGAAATTTGTTAAACCTAAACCTTTCGTGCGGTTATGGAACCCTCCATTTAAGAGGTGCCCAATAATCCGCCCCGTTGT 3 1 5' arm Cichorium_intybus mirnest 100 100 -28.6 ........(((.((((((.(((.((((((((((.((((.(((..(((((((....)))))))....))).)))).))))))))))..))))))))).)))........ (-28.6)