mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAGAAGAGAGTGAGCATA TGCTCACTTCTCTTGCTGTCAGC AAAAAGAAAGCTGACAGAAGAGAGTGAGCATATGCAAACAATTGTATAGAGAGGTATACACTTGTAAATATGCGTGTGCTCACTTCTCTTGCTGTCAGCTACTCGGT GTGGAGAGACCCACATGATGTTTAATTAGTCTTGTCTCCCTCTTTTACTACTTATACGATGACGATGATGATATTAGAATGGTAATCAGAATGTTGTTTGCTTCATCTTCGTCTTCAACAAGTTCCTATAGCTTCTGGCTTTTTTCTTTTCTTTCTAAAAGTCAACTCAAACACTGTACATACAATTTTCTTGATTTGGTTTCGAGTCCCAACAATGATTCTACTGTTCTACATGTACACTACAGGTGGGTTTTCTTTCTTTTTGCTAGATACGAAACTTTTATTGTTTTAGATCTGAATTTATATTATCTTTATATTTCATCACAGGATATAGAAGTGTGTGGATGAAATTAAAAAGAAAGCTGACAGAAGAGAGTGAGCATATGCAAACAATTGTATAGAGAGGTATACACTTGTAAATATGCGTGTGCTCACTTCTCTTGCTGTCAGCTACTCGGTGTAACTATTACAGTAACCTACATCTCTTTTCTTTTCTTTTATTTTTTCCTTGTATTTTATGTGTTTTTATGATCATGTTTTGTTTCTTCTTGTGTGTCATTGGATAAGATAGAACTCTAGAGTGCCACCTGGACAGAGACCTGTGATTCAGACACCATCGTCCACCGTCCGCTACCACCACCACTGTATTGAAGAAAAAGCTGCTACGTCTGACGACTAATTACACACATACCCTTCTAATCTATGATATATTTCTTTCTCTCTCTCTATTCTTTTTTACCCTTTCCGAATTCTATCTCGTTGATGCATAACAAT 0 2 5' arm Cichorium_intybus mirnest mir-156 0.0004 zma-MIR156c 0.0000003 -47.3 ........((((((((((((((((((((((((((((.((((.((((((......)))))).)))).....))))))))))))).)))))).)))))))))....... (-47.3)