mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGCAGCATTGTACAGGGCTATCA AGCTTCTTTACAGTGTTGTCTTG TCTGTGTGCTCTGAGCTTCTTTACAGTGTTGTCTTGTGGCATGGAGATCAAGCAGCATTGTACAGGGCTATCACAGCACACTGAACAGC 1 4 3' arm Danio_rerio mirbase mir-103 2e-26 fru-mir-107 9e-29 -34.5 ((.(((((((.((((((.((.((((((((((.((((...(.....)..)))))))))))))).)))))..))).))))))).))..... (-34.50)