mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGGCACGCGGTGAATGCCAA CGTGTTCACGGCGGACCTTGAT GGGTGGTGACACAGGCCCGCCACTCTGCGTGTTCACGGCGGACCTTGATTTAATATCCATACAATTAAGGCACGCGGTGAATGCCAAGAGAGGGGTCTTAAAACGACAAACCC 4 1 3' arm Danio_rerio mirbase mir-124 2e-39 gga-mir-124a-2 7e-30 -43.1 (((((....)..((((((.(..(((((.((((((((.(((..((((((((............))))))))..))).))))))))).)))).)))))))...........)))) (-43.10)