mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCCTGAGACCCTAACTTGTGA ACAGGTTAAGCTCTTGGGACC CCCGTGCGGCCACCGCTGCACTCCTCCTGGTCCCTGAGACCCTAACTTGTGAGCTTTGTGTGCTAAAAATCACAGGTTAAGCTCTTGGGACCTGGGCAGAGGGCAAAAGCACTGG 2 1 5' arm Danio_rerio mirbase lin-4 6e-34 xtr-mir-125b-2 0.00000002 -49.2 ((.((((.(((....((((......((.((((((.((((.(.((((((((((..((((.....))))..)))))))))).).)))))))))).))))))..)))....)))).)) (-49.20)