mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTAGATATATCCATGTTGTGGC TTCAATATTGGGTGTATTTTTTTCAGA GCGATGTTGGCTGTAGATATATCCATGTTGTGGCTTGACTCAGTGGTTTCAATATTGGGTGTATTTTTTTCAGAAGGCATGT 3 4 5' arm Saccoglossus_kowalevskii mirbase 100 100 -25.3 ...(((((..(((.((((((((((((((((..(((.........)))..))))).)))))))))))....)))..))))).. (-25.30)