mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTTGGTTATCTAGCTGTATGA ATAGGTCTAGGTGACCGAAGTTA TCTTTGGTTATCTAGCTGTATGAGTGTTACGTATGAAGCTCCTCATAGGTCTAGGTGACCGAAGTTA 3 0 5' arm Acyrthosiphon_pisum mirbase mir-9 1e-30 mdo-mir-9-1 0.0000000008 -27.2 .((((((((((((((.(.((((((.(((........)))..)))))).).))))))))))))))... (-27.20)