mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGTGTTCAACCTTACAGTGAG CACTTTAAGTTTGAGCACCAAGC CACTTTAAGTTTGAGCACCAAGCCTCAGGCTTATTGTTTGGTGTTCAACCTTACAGTGAG 4 0 3' arm Acyrthosiphon_pisum mirbase 100 api-mir-971-1 2e-28 -25.3 ((((.((((.(((((((((((((............))))))))))))).)))).)))).. (-25.30)