mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACTAGAGTTACACTCGTCA ACGGGTGTAGTCTTTAGTGCACG ACGGGTGTAGTCTTTAGTGCACGTTAATATTTATAGTCGTGACTAGAGTTACACTCGTCA 2 2 3' arm Acyrthosiphon_pisum mirbase 100 api-mir-996-2 2e-28 -24.8 ((((((((((.(((((((.(((((((.......))).))))))))))))))))))))).. (-24.80)