mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGCCAGCTTTGATGAGC TCTCAAAGTGGCTGTGAAATG GCATGTCCTGTCTCTCAAAGTGGCTGTGAAATGGTGCACTTTCGATCCGATATCTCATATCACAGCCAGCTTTGATGAGCTAGGCCG 2 2 3' arm Anopheles_gambiae mirbase mir-2 2e-36 dan-mir-2a-2 0.000000001 -33.2 ....(.((((.((((((((((((((((((.((((.......(((...)))....)))).))))))))).)))))).))).)))).). (-33.20)