mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATCACAGCCAGCTTTGATGAGC CATCAAACTTGGTTGTTGTAGC TATTGGGTGCCATGCATTGTCATCAAACTTGGTTGTTGTAGCTTGCTTTGATAGTTGCTATCACAGCCAGCTTTGATGAGCAATGCGTCACTTACCTA 3 0 3' arm Anopheles_gambiae mirbase mir-2 8e-33 aae-mir-2c 0.00000008 -43.6 ...((((((..((((((((((((((((.((((((((.(((((..(((.....))).))))).)))))))).)))))))).))))))))....)))))) (-43.60)