mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTTGGTATTCTAGCTGTAGA TAAAGCTTTAGTACCAGAGGTC TTTCCGGCTGTATCTTTGGTATTCTAGCTGTAGAATGTTGTTTTCATTGTAATATCTCTAAAGCTTTAGTACCAGAGGTCCAACTGGGAA 3 0 5' arm Anopheles_gambiae mirbase 100 cqu-mir-9 5e-18 -34.4 .((((((.((.((((((((((((..((((.((((((((((.........)))))).)))).))))..)))))))))))).)).)))))). (-34.40)