mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGTATTACATCAGGTACTGGT CAGTACTTGTGTTATACTCTCC CCGGGGTGAGTATTACATCAGGTACTGGTGTGTAATTTAAACGACCATCGGACATGGGGGCTGCCCAACTCCTCTTCTGTCCCCGGTCAAGCTATCAGTACTTGTGTTATACTCTCC 2 1 5' arm Anopheles_gambiae mirbase mir-12 0.0000004 ame-mir-12 0.00000002 -43.13 ....((.((((((.(((.((((((((((((.((........((.....))(((.(((((((.................))))))))))..))))))))))))))))).)))))).)) (-43.13)