mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACTAGATCCACACTCATTAA AATGGGTGTGAATCTAGTGATTTCACA TTCCTATCAGTGTAAATGGGTGTGAATCTAGTGATTTCACATGAATTTTCGATTGTGACTAGATCCACACTCATTAATGTTGTTTGGAA 2 5 3' arm Anopheles_gambiae mirbase mir-279 3e-44 aae-mir-279 0.000000000004 -31.9 .(((...(((..(.((((((((((.((((((.....((((((((....)))..))))))))))).)))))))))).)..)))...))). (-31.90)